IrsiCaixa crea una web para controlar las variantes de SARS-CoV-2 en España

La herramienta CovidTag es abierta y cuantifica las muestras secuenciadas por territorio

CovidTag permite obtener el número total de muestras secuenciadas en cada región. — IrsiCaixa crea una web para controlar las variantes de SARS-CoV-2 en EspañaIrsiCaixa

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Creado: 04.05.2021 | 09:34

Actualizado: 04.05.2021 | 09:34

El Instituto de Investigación del Sida IrsiCaixa ha creado una página web con información de la evolución de las variantes del coronavirus en el estado español. La herramienta, denominada CovidTag, es abierta y permite obtener el número total de muestras secuenciadas en cada región. Así, se ve cómo Navarra es la comunidad autónoma que más muestras está secuenciando por habitante y como Cataluña es la región con más muestras totales secuenciadas. «El objetivo de esta página web es compartir con todo el mundo y en directo la situación actual de la pandemia en el estado español y hacer un seguimiento geográfico de las variantes que van apareciendo», afirma Marc Noguera-Julian, investigador asociado a IrsiCaixa y cocreador de CovidTag (http://covidtag.paseq.org/ ).

La actualización semanal de la información es posible gracias a la base de datos de GISAID, una plataforma que ofrece datos genómicos globales relacionados con el coronavirus.

«La cantidad de muestras secuenciadas puede ser muy dispar entre comunidades autónomas, y eso hace falta tenerlo presente a la hora de interpretar las frecuencias de las variantes en cada región», apunta Francesc Català, data engineer en IrsiCaixa y cocreador de CovidTag. «Cuantas más muestras haya secuenciado una comunidad autónoma, más representativa será la prevalencia de cada variante en aquel territorio», aclara.La herramienta muestra cómo las nuevas variantes van desplazando las anteriores.

CovidTag quiere ser una herramienta útil para el personal sanitario e investigador a la hora de implementar estrategias de prevención y diseñar estudios, respectivamente, pero también para la población general interesada en hacer un seguimiento actualizado de las variantes.

«Una de las cosas que nos ha enseñado esta pandemia es la necesidad de tomar medidas de restricción a tiempo con el fin de mantener el virus a raya y evitar al máximo la aparición de nuevas variantes», indica Roger Paredes, investigador principal en IrsiCaixa, centro impulsado conjuntamente por la Fundación La Caixa y el Departamentde Salut.