Definen la primera secuencia genoma del coronavirus para estudiar la inmunidad

Este artículo ha sido publicado en formato Open Access en la revista Vacunas. «Se trata de una herramienta clavepara el análisis de la respuesta inmunitaria que permitirá acelerar la investigación y el desarrollo de una vacuna, por eso lo teníamos que hacer accesible a todo el mundo», remarcan los líderes del estudio, Christian Brander y Julia G. Prado, investigadores principales de IrsiCaixa en el grupo de Inmunidad Celular y Genética del Huésped y al grupo de Evasión Inmunitaria y Vacunas, respectivamente.

El sistema inmunitario es el encargado de proteger nuestro cuerpo de patógenos como los virus. Uno de los mecanismos al detectar un virus es la respuesta inmunitaria adquirida, que incluye los anticuerpos, encargados de neutralizarlo, y las células T, capaces de identificar y destruir las células del cuerpo infectadas por el virus. Esta acción de las células T se conoce como inmunidad celular, es persistente en el tiempo y sirve de «memoria» en futuras infecciones.

«Detectar si se ha desencadenado una respuesta inmunitaria celular es complicado, ya que hace falta conocer qué partes del coronavirus activan las células T», explica el investigador asociado a IrsiCaixa Alex Olvera, primer autor del artículo junto con el investigador asociado Marc Noguera-Julian.

Hasta ahora, los estudios publicados se han centrado o bien en algunas proteínas virales o bien en secuencias únicas del virus. «No queríamos obviar una parte de la respuesta inmunitaria que parece ser clave en la generación de la memoria inmunológica contra elvirus. Es por eso que hemos diseñado esta herramienta, un listado de moléculas que permite tener en cuenta el genoma completo de virus y su capacidad de variación», añade Noguera-Julian.

Miles de péptidos para estudiar la inmunidad celular

Los investigadores han comparado las secuencias completas de 1.700 genomas de SARS-CoV-2 que circulanpor todo el mundo y disponibles enplataformas online públicas. Mediante el análisis de todos estos datos han podido definir una secuencia genética representativa del virus, así como obtener un listado de todos los posibles fragmentos de proteínas que puede producir el virus.

«Hemos visto que el SARS-CoV-2 no muta mucho y no es un virus con mucha variabilidad genética, a diferencia por ejemplo del VIH, pero hay que tener en cuenta cuáles son las posibles variantes para poder estudiar la respuesta inmunitaria que se generará delante de cada uno de los virus y no perder ningún detalle», remarca Olvera.

Además, han detectado que algunos de los péptidos están muy conservados entre varios virus de la familia coronavirus. «Eso puede ser clave para generar una reacción cruzada, es decir, una respuesta inmunitaria capaz de proteger tanto del virus del resfriado común como del SARS-CoV-2», apunta Noguera-Julian.

Una herramienta para acelerar la investigación

Esta herramienta permite a los investigadores de IrsiCaixa estudiar la inmunidad celular contra el SARSCoV-2. «Queremos entender qué respuesta inmunitaria hay detrás de los individuos que no generan anticuerpos contra el virus y pasan la infección por SARS-CoV-2 con poca sintomatología clínica y qué péptidos son capaces de inducir esta respuesta», destaca G. Prado.

«El uso generalizado de esta secuencia consenso en la investigación del sistema inmunitario contra el SARSCoV-2 asegurará la comparabilidad y reproductibilidad de los resultados entre laboratorios y eso acelerará mucho el proceso de investigación», remacha Brander.